男同性恋
爱滋感染
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肛交为男同性恋者间常见的性交方式之一，如同其它进行体液交换的男女性交方式一样，同为感染HIV病毒的管道之一。
2013年很多国家的艾滋病控管机构发表当年的统计，发现艾滋病的感染率在男同性恋者当中有上升的趋势。总结其因素为不使用保险套的性行为增加，以及没有进行适时的艾滋病病毒检测。
美国疾病控制与预防中心2013年的报告显示，2005年到2011年间，美国男男性行为者在过去12个月中不使用安全套的肛门性交行为增加了20%。2011年，全美48个州中，一半的新感染案例都是通过男男性行为发生的[19]。
英国公众健康部门2013年发布的统计发现，2012年共有3,250名男同性恋者和双性恋者感染HIV，为英国有记录以来最高的数字[20]。
研究显示，对爱滋感染者污名化，以及对群体的各种标签化行为，容易导致个体会避免面对HIV的相关检测，而成为疾病筛检预防上的漏洞。在整个疾病预防的角度上，污名化与安全性行为呈现负相关，显现出在污名化严重的区域中，安全性行为的推行更加不易[21]。
恐同情绪
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恐同症的全名是“同性恋恐惧症”，由George Weinberg于1972年提出，指畏惧跟同性恋者有近距离接触，且想施加惩罚于同性恋者身上的一种病症，这种恐惧大多是不理性的。但此概念逐渐脱离临床症状，而应用于社会及文化范畴，指对于同性恋者没来由的恐惧、歧视、偏见、攻击等。有学者区分出“内化恐同” (internalized homophobia)，以及“制度化恐同” （institutional homophobia）两种概念。前者指人们对于自己被同性吸引的事实产生羞耻感、自我憎厌等，而后者则指学校、政府、商业机构、宗教团体等社会体制，在政策及人事上，对不同性倾向人士的不公对待和歧视[22]。
“恐同”产生的机制困扰著心理学家们，直到现在，人们还没有得到一个明确的结论。基尔马丁教授（Prof. Kilmartin）主张，男性恐同者的恐惧可能来自性别刻板印象。换言之，对于一些男性而言，与男同性恋来往让他们感觉自身“男子气概”受到威胁。当他们与男性同性恋接触时，他们感到自己的价值观受到挑战，进而产生不安全、焦虑、恐惧、愤怒等负面情感。恐同态度“保护”他们不被“同性恋式的行为”威胁，从而保全自己的“男子气概”[23]。
根据加拿大学者安德森（Richard Andersen）与费特娜（Tina Fetner）的研究，对同性恋的友善程度可能和贫富差距有关。他们比较三十五个民主国家的“世界价值调查”样本后发现：经济不平等扩大时，对同性恋不友善的程度会升高。反之，国家经济成长后，对同性恋宽容度随之提高[24]。
一份美国研究综述发现，对同性恋持负面态度的人，通常[25]：
较少和男女同性恋有接触往来
较少参与同性性行为或认同自身为同志
倾向对同侪感知到负面态度
童年时期居住在把“反对同性恋”当作规范的地区
比较年长和未受过教育
较为虔诚，常上教堂，并且保有保守派的宗教意识形态
倾向表达传统、刻板的性别角色
对性持保守、负面或罪恶的态度
倾向威权主义或具相关之人格特质
对同性恋的恐惧和刑事定罪阻碍了关于MSM和HIV传播的研究，也阻碍了这些国家控制HIV的努力[26]。
性悖轨法
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主条目：性悖轨法
男男之间的性交行为在历史上曾被很多国家所禁止，违者会受到严厉的惩罚。即使是现在，两名成年男子之间自愿的性交行为在全球70个国家有刑事风险。联合国人权理事会在1994年认定同性性行为入罪是以国家法律歧视他人性倾向，违反人权保障[27]。